RNA編輯 (RNA editing)是一種重要的轉(zhuǎn)錄后修飾,以維持在RNA水平的基本功能,其廣泛存在于病毒、原生動物、后生動物、真菌和陸生植物中。在陸生植物中,RNA編輯由三角狀五肽重復蛋白(pentatricopeptide repeat, PPR)所介導。作為苔蘚植物中起源古老的一個分支,地錢綱(復雜葉狀體苔類植物)是陸生植物唯一一類缺乏RNA編輯的類群。為什么地錢綱缺乏RNA編輯長期以來一直是個謎。
光苔是以洞穴為主要生境的一類地錢綱植物,在弱光下有發(fā)光特征,目前只有一個科一個屬,全世界只有12個種,大多是稀有和保護物種。基于復雜葉狀體的全面取樣,通過對產(chǎn)于廣西洞穴的野生材料進行無菌培養(yǎng)和基因組測序以及相關實驗分析,華東師大苔蘚植物研究團隊驚奇地發(fā)現(xiàn)光苔具有豐富的C-to-U RNA編輯位點,并且證實光苔同時具有大量PPR編輯因子,包括251個DYW型PPR蛋白。研究人員推測光苔顯著的RNA編輯能力可能是隨著DYW型PPR編輯因子的出現(xiàn)而獲得,并提出了二種假說。這些發(fā)現(xiàn)有助于深入了解陸地植物RNA編輯的進化模式。隨著光苔人工培養(yǎng)體系的建立和后續(xù)光苔全基因組序列的發(fā)表,光苔有望成為進一步研究陸生植物RNA編輯的一個理想的模式植物。
上述研究成果近期以Is RNA editing truly absent in the complex thalloid liverworts (Marchantiopsida)? Evidence of extensive RNA editing from Cyathodium cavernarum為題在線發(fā)表在著名植物學期刊New Phytologist。

New Phytologist 在線刊發(fā)華東師大苔蘚植物團隊研究成果

圖1. 左:適合光苔生長的洞穴生境(廣西桂林);右:洞穴內(nèi)光苔居群

圖2. 左:光苔植物體特寫;右:光苔的孢子和彈絲

圖3. (a) 地錢綱植物的PPR基因的分布;(b) 小立碗蘚(Ppa)和光苔(Cca)的DYW結(jié)構(gòu)域序列的比較

圖4. 左:光苔葉綠體基因組及RNA編輯位點(黑體);右:光苔線粒體基因組及RNA編輯位點(黑體)
華東師范大學生命科學學院苔蘚植物學實驗室的博士研究生沈超、徐浩、黃文專分別為第一、第二和第三作者, 趙瓊研究員和朱瑞良教授為通訊作者。該工作得到了國家自然科學基金和華東師范大學“幸福之花”先導研究基金的資助。
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論文鏈接:https://doi.org/10.1111/nph.19750
來源|生命科學學院、科技處 編輯|沈婷鈺 編審|郭文君